科研体制不健全，是导致中国种业陷入研发困境、难出大品种、好品种的根本原因。充分发挥市场在种业资源配置中的决定性作用，强化企业技术创新主体地位，为育种人才提供“金降落伞”，鼓励他们加盟有实力的种业企业。
清理、整顿种子市场，严格执法，净化种子营销渠道和市场，让农民能买到真实、放心、优质、高产农作物种子。农作物种子应建立合法进入市场的渠道，特别是大型有信誉、有实力的拥有全国育繁推一体化资质的种子公司的种子，在品种审定、推广上应给与政策支持;提高种子企业经营门坎，严查种子经营企业实收资本是否到位;净化、壮大执法队伍，加大种子真实性抽样调查，严厉打击售卖假种子、套牌种子的企业和个人。
政策层面上来讲，国家或行业主管部门应制定配套的财政、金融、税收政策，积极支持企业之间的兼并重组、收购等行为，如：收购企业资产中涉及到的增值税、企业所得税应予以减免，收购股权中涉及到的个人所得税予以优惠，给予收购主体更多的资金支持。
产业领域内看，应鼓励全国育繁推一体化企业为主体，推动种业产业上下游企业之间的整合、重组，建立完整的产业链，提高产业内部的配合力。比如，收购专业技术型研发公司，繁、育种专业基地建设;或者在同一品种作物内，整合、重组企业，完成市场的合理布局，丰富多区域市场的品种结构，壮大单体企业规模，增强实力，提高抗风险的能力。
另一方面，还应该积极完善种业法人治理结构，构建市场化运行机制，全面提高种业企业管理水平，推动更多种业企业上市。针对国内种业企业现状，鼓励和支持一批企业实行改制、改组，按资本市场的要求，完善公司法人治理结构，构建市场化运行机制，全面提高种业企业管理水平，向企业管理要效益。同时，应给予中国种业企业特殊的支持政策，鼓励和支持更多企业走向资本市场，为企业的发展进入快车道提供法人治理结构保障、制度保障和资金保障。
