看谷壳色 杂交种谷壳上略带不均匀的黄褐色等生理性杂色，而父本，保持系等谷粒颜色较为一致。保持系和其它杂株谷粒比杂交种子透明度高，谷壳比杂交种子光滑。
看柱头痕迹 非杂交稻种谷粒因多属自花授粉，雌蕊柱头不外露，柱头痕迹遗留在谷壳内部，剥开谷壳在米粒顶部可见一点浅黑色的柱头痕迹。而杂交种子属于异花授粉，柱头外露，仔细观察谷粒内外稃夹缝中间，可发现一点不很明显的小黑点即柱头痕迹，这是识别杂交种子里其它稻粒的重要依据。
看种子净度 用手抄，掌上或指缝间有固体颗粒如土粒砂粒等杂质，手背沾有细粉状物，证明种子净度达不到国家规定的标准99%。
测种子含水量 简便方法使用牙咬，如谷粒有尖脆响声，则含水量基本上达到13.5%；若无尖脆声或谷粒断面不齐，则种子含水量一般高于13.5%。
