2014年化肥进口关税配额实行先来先领的分配方式。其中，国营贸易配额数量分别为：尿素297万吨、磷酸二铵352万吨、复合肥176万吨，非国营贸易配额数量分别为尿素33万吨、磷酸二铵338万吨、复合肥169万吨。
2014年起始数量以2013年起始数量为基础，并按以下情况进行调整：2013年核销率在80%以上的企业，上调40%；2013年核销率在50%~79%的企业，上调20%；2013年核销率在25%～49%的，维持不变；2013年核销率在25%以下的，扣减50%；2013年之前有业绩，但2013年没有申领化肥进口关税配额证明的企业，起始量维持不变；新申请企业起始关税配额2000吨。
