小麦的纹枯病一般有两个发病高峰期，小麦纹枯病的发生流行具有冬前和拔节期二个发病高峰，而冬前病害的发生程度又直接影响到后期病害与危害程度。因而重点控制前期、延缓病原菌侵染期和麦株发病期，降低病害严重度和危害损失，发病率高的重病田块应结合冬前和早春防治措施。
小麦的纹枯病可分两个时期进行防治：在发病初期和返青期进行药剂防治。即每亩用50毫升井岗？蜡芽菌+15毫升海绿素或10毫升申嗪霉素+5毫升爱多收+20克磷钾动力对一桶水进行喷雾，间隔5-7天，连续2-3次为宜。
小麦纹枯病又称立枯病、尖眼点病。主要危害植株基部的叶鞘和茎秆。小麦发芽后，芽鞘受病菌侵染变褐最后腐烂枯死。在3-4叶期时叶鞘上先产生淡黄色小斑点，后发展成典型的黄褐色梭形或眼点状病斑。病部逐渐扩大，颜色变深，并向内发展延及茎秆，基部茎节腐烂，幼苗不抽新叶，猝倒而死亡。
