隔离包括场舍的隔离、人员的隔离、设施的隔离和操作的隔离。鸡场内部要区分为生产区和生活区，区与区之间需设消毒设施。鸡舍门口设有车辆消毒池和人员淋浴消毒室，所有进出场人员必须淋浴消毒；鸡场谢绝参观，禁止外来人员进入鸡场；本场人员实行封闭式管理，在饲养期间不得随意外出；外出进场后需执行严格的洗澡、消毒制度；外出人员不得接触禽类及食用禽类相关产品，以确保回场后的生物安全；外来车辆及动物产品不得随意进入场区，进出场区的车辆及物品必须经严格的消毒后方可出入等等；使外界病原不能进入鸡场内部，进而确保鸡场的生物安全。
二 科学有效消毒程序的建立
1 鸡场周围环境消毒
要求每天清扫、整理鸡舍周围，生产区内要求无杂草、垃圾，保持鸡舍外的清洁性；场区内净道和污道分开，雏车和饲料车走净道，病死禽和鸡粪走污道，并在远离鸡场处设有无害化处理区进行无害化处理；场区道路每3天喷洒消毒药一次；每周清理鸡舍周围杂草；不得乱放物品；不得乱丢垃圾；定期喷洒杀虫药消灭昆虫，定期投放灭鼠药。
2 鸡舍外消毒池的管理
保持消毒池清洁，每天清刷并更换消毒药，保持消毒液新鲜，消毒液每周定期更换，交叉、轮流使用，以确保消毒效果；冬季结冰时，可添加食盐，防止冻结；人员进出必须更换胶靴，经过消毒池
3 鸡舍的带鸡消毒
带鸡消毒就是对鸡舍内的一切物品及鸡体、空间用一定浓度的消毒液进行喷洒消毒，以清除鸡舍内的多种病原微生物，阻止病原在舍内积累，并能有效降低舍内空气中浮游的尘埃，避免鸡群呼吸道疾病的发生，确保鸡群健康。网上饲养的肉鸡，每日对鸡群进行喷雾消毒可以减少疫病的发生，在夏天还可以起到防暑降温的作用。带鸡消毒的药物必须慎重选择，一是必须高效、广谱、强力；二是对金属和塑料制品的腐蚀性小，三是对鸡和人的吸入毒性、刺激性、皮肤吸收性小。带鸡喷雾消毒由专人进行，网上饲养肉鸡带鸡消毒可以1～2次，地面平养肉鸡带鸡消毒3～4天一次，避免地面过于潮湿而引起球虫病的发生。消毒药一般用过氧乙酸、新洁尔灭百度杀、碘制剂等。消毒药现用现配，不宜久存。消毒药的使用浓度严格按说明书进行配比．对不易溶解性消毒药必须充分搅拌使其溶解。在操作中应当注意，带鸡消毒不仅局限于鸡体表面，而应当包括鸡群昕在的空间及环境，否则就不能取得良好的消毒效果，对疫病进行较好的控制。
带鸡消毒时应注意的问题：选用两种以上消毒药定期更换交替使用，以确保消毒效果；疫苗免疫接种前后3天内或在饮水中加入其它有配伍禁忌的药物时，应暂停带鸡消毒，以防影响免疫或治疗效果。带鸡消毒时间最好固定，且在暗光下进行，以防产生应激；消毒人员应带防护用具，以免消毒药物刺入眼睛、手、皮肤及粘膜；严禁使用刺激性大的消毒药带鸡消毒。
4 人员消毒
人是最大传染源，因此，饲养人员进入鸡舍必须经洗澡消毒，洗澡时间在20分钟以上，并结合使用灭菌香皂，饲养人员的手经清洗消毒后，再用75％的酒精涂擦消毒，戴上手套、帽子，换上鸡舍专用的工作服及鞋经脚踏消毒进入鸡舍工作，舍内衣服不得穿出舍外，工作服每2天清洗消毒一次，并高压灭菌。维修人员进入鸡舍遵循饲养人员进鸡舍程序；各舍之间饲养人员不得串舍，不得互相借用饲养工具及设备，舍内用具及设备固定。技术人员检查工作时不得同时进入两栋鸡舍，如遇特殊情况，必须经严格洗澡消毒后方可进入；其它人员不得进入鸡舍。
5物品的消毒
一切物品在进入鸡舍前必须经过严格的消毒或灭菌处理后方可进入，根据不同物品选择不同的消毒方式。对耐腐蚀性物品能经消毒药浸泡消毒或喷雾消毒的采用浸泡或喷雾消毒；不耐浸泡的采用熏蒸消毒或紫外线照射消毒。为确保生物安全，各舍使用的饲养工具必须经严格的消毒后方可使用，非生产性用品严禁带人生产区内。
6 空鸡舍的消毒
包括鸡舍的排空、机械性清扫、高压水抢冲刷、消毒药消毒、干燥、熏蒸消毒。熏蒸后最好密闭72小时，熏蒸密闭时间越长消毒效果越好。
