据了解，棉花中后期病虫害总体呈中等程度发生，发生危害重于前期，仍以虫害为主，主要种类有棉铃虫、棉盲蝽、蚜虫、棉叶螨和烟粉虱;病害主要有黄萎病和铃病。预计棉花中后期病虫害发生1.8亿亩次，其中虫害发生1.5亿亩次，病害发生3000万亩。
棉铃虫：三代棉铃虫预计发生面积2500万亩,全国各棉区总体为中等发生，河南、河北、江苏和安徽等省份的局部地区偏重发生。第二代成虫盛期(成虫盛期推后3天即为三代卵盛期)，长江流域棉区、黄河流域多比常年早或接近，西北内陆棉区的新疆和甘肃偏晚，具体时期见表1。四代棉铃虫发生面积1500万亩，长江流域棉区中等发生，黄河流域和南疆棉区偏轻发生，幼虫发生盛期在8月下旬至9月中旬。
棉盲蝽：预计三代发生1600万亩，长江流域和黄河流域及新疆南部为中等发生;发生盛期在7月中旬至8月上旬。四代发生1500万亩，长江流域和黄河流域大部为中等发生;发生盛期在8月中旬至9月上旬。
棉蚜：伏期棉蚜预计发生3000万亩，新疆北疆的局部地区可达偏重发生，其他大部棉区为中等发生;发生盛期在7月下旬至8月中旬。
棉叶螨：预计发生2300万亩，江西和江苏等地可达偏重发生，长江流域其他大部地区和新疆大部为中等发生，黄河流域棉区为偏轻发生;发生盛期在7月下旬至8月中旬。
烟粉虱：预计发生1500万亩。长江流域、黄河流域和新疆南疆和东疆为中等发生;发生盛期为8月份。
红铃虫：预计在长江流域棉区发生呈上升势头，总体为偏轻发生，发生面积约为450万亩。
黄萎病：预计发生1000万亩。河北、湖北和新疆的局部棉区中等发生，黄河流域、长江流域和新疆大部棉区偏轻发生;发生盛期为8月中旬至9月上旬。
铃病：在各棉区有中等发生的风险，预计发生面积为1000万亩;发生盛期为 8月中旬至9月中旬。
