但是，长期过量不合理的化肥使用，让我们赖以生存的耕地“越喂越瘦”，失去了应有的活力，同时为生态环境与农产品质量安全带来了严峻挑战。如今，过度依赖化肥等化学投入品的传统农业已难以为继。
日前，在河北保定召开的“中国首届生物菌肥创新应用高峰论坛”上，农业部微生物肥料和食用菌菌种质检中心主任李俊表示，微生物是解决农业可持续发展问题的突破口，微生物肥料将成为引领未来肥料产业发展的新方向，支撑中国农业可持续发展的必然选择。
“中国用占世界7%的耕地，养活了世界22%的人口。”这个奇迹的背后，是在有限的耕地上“精耕细作”。由于人多地少，我们的耕地不能像发达国家那样进行休耕与轮作，得不到休养生息的机会。
为了保障粮食的有效供给，从上世纪70年代开始，中国农业进入化学农业时代。目前，中国是世界上最大的氮肥生产和使用国，氮肥用量占到全球总用量的30%，且肥料的利用率十分低下，氮肥的利用率仅为35%；我国单位面积化肥用量是发达国家的两倍，利用率只有美国的一半左右。
李俊说，
由于长期不合理使用化肥，破坏了土壤的活力，导致耕地生产力下降，我国化肥报酬急剧递减：1975年，每公斤化肥能生产25公斤谷物，到2005年，每公斤化肥只能生产10公斤谷物，30年递减了50％-60％。
分析其原因，李俊表示，过量不合理的化肥（尤其是氮肥）使用，导致土壤酸化、板结、有机质含量下降、功能微生物区系结构失衡；加上农药与除草剂残留、重金属与抗生素污染等，导致土壤不堪重负。长期大量化学投入品的使用，使土壤处于“亚健康”状态，失去了活力；土壤不健康，也造成了农产品品质下降。
随着城镇化进程的推进，耕地逐年减少，水资源严重短缺，耕地生产力下降，生态环境恶化，如何保障未来农业可持续发展，将是中国面临的一大课题。另外，如今“舌尖上”的安全已成大众关注的热点。李俊认为，要保障人的健康，源头就是要保障土壤的健康。微生物制剂以及微生物肥料，能消除土壤的有毒、有害物质，分解如秸秆等有机物料，对提升土壤活力，保障土壤健康与农产品质量提升、促进农业可持续发展等方面具有不可替代的独特作用。
实践证明，微生物肥料具有提高作物产量、改善品质、增强作物抗逆性、提高化肥利用率、改善土壤活性等功能，现在已受到了世界的广泛关注，美国科学家甚至提出 “用微生物养活世界”。
近年来，我国高度重视生物肥料产业的发展，国务院发布的 《生物产业发展规划》，把生物技术定位为未来发展的战略性新兴产业之一，生物肥料被列入科技部发布的 《“十二五”生物技术发展规划》重大生物产品之一。针对我国化肥使用超量、低效、耕地质量逐年下降的突出问题，以减少化肥施用量、改善耕地质量为主要目标，开展新型高效生物肥料产业化。到目前，国家跟进的支持生物肥料产业化发展的项目接近10亿元人民币。
据了解，目前，我国微生物肥料主要有三类，分别是农业微生物菌剂、生物有机肥、复合微生物肥料。我国微生物肥料企业总数目前在950个以上，年产量1000万吨，年产值150亿元。截至2014年6月，农业部登记注册的产品有2015个。近年来，我国微生物肥料每年应用面积超亿亩，大多数在蔬菜、果树、中药材、甘蔗等经济作物上使用。
与国外相比，新的功能菌种的研发、科学合理的工艺、产品质量的提高、生产成本的降低、应用效果的稳定等问题，仍是我国微生物肥料产业面临急需解决的课题。
李俊认为，未来，有机物料腐熟菌剂、土壤修复菌剂、根瘤菌剂和溶磷菌剂，果树、蔬菜等经济作物专用的功能菌剂、生物有机肥、抗旱菌剂等产品，将成为研发推广的热点。
